La Universidad del Atlántico es el segundo centro de educación superior del país que se incluye en el Registro Único de Víctimas. El primero fue la Universidad de Córdoba. La Unidad Nacional de Reparación de Víctimas entregó la resolución en la que se notificó a la Uniatlántico que se le incluye en el Registro Nacional de Víctimas por el asesinato de los directivos Alfredo Castro y Luis Meza Almanza, del profesor Jorge Freytter Romero, y del estudiante Reynaldo Serna.